RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.55□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 A0A087WTM6 91 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 PGPA6NDG6 321 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 C9JCJ5 164 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 DIRC3C9JPN6 131 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 H0YIZ8 118 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.522e-6■□□□□ 11
COCH-211ENST00000557065 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 KHDC3LQ587J8 217 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 TMED6Q8WW62 240 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 HYLS1Q96M11 299 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 ATP5SQ99766 215 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 OTORQ9NRC9 128 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 MBD2Q9UBB5 411 aa5.54□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PPV4 95 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 M0R2P5 195 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 GNRH2O43555 120 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 CRYGDP07320 174 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 XGP55808 180 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 TDRG1Q3Y452 100 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 NAGKQ9UJ70 344 aa5.53□□□□□ -1.52
COCH-211ENST00000557065 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 PET100P0DJ07 73 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 GCSHP23434 173 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 H2BFSP57053 126 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 KRTAP10-1P60331 282 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 FRZBQ92765 325 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 KCNS1Q96KK3 526 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 HSPB11Q9Y547 144 aa5.52□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 HSPG2P98160 4391 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 PSCAO43653 123 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 SSNA1O43805 119 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 UPK1BO75841 260 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 MPC2O95563 127 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TIRAPP58753 221 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TREM1Q9NP99 234 aa5.51□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 CIDEAO60543 219 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 PPT1P50897 306 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 ZNF876PQ49A33 203 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 Q5VSD8 79 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 ASB13Q8WXK3 278 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.5□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 F6UZH7 168 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 K7EQM0 130 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TAAR5O14804 337 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TYMSP04818 313 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 IFITM3Q01628 133 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TVP23CQ96ET8 276 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.49□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.48□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 DEFA1P59665 94 aa5.48□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 DEFA3P59666 94 aa5.48□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 RAB2AP61019 212 aa5.48□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.48□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 SGK494Q96LW2 274 aa5.48□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms