RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554534.5

PCNX4-208, Transcript of pecanex 4, human

TSL 3

Gene PCNX4, Length 357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX4-208	ENST00000554534	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	S100A5	P33763	92 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	GNG5	P63218	68 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	GAGE1	Q13065	139 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	GAGE4	Q13068	117 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	GAGE5	Q13069	117 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	ZNF266	Q14584	549 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	PGP	A6NDG6	321 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534		M0R2P5	195 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	PLA2G10	O15496	165 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	OR7C2	O60412	319 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	SULT1A1	P50225	295 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534		Q6ZSA8	131 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	SPX	Q9BT56	116 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	JPT2	Q9H910	190 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	RS1	O15537	224 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	NMB	P08949	121 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	S100A11	P31949	105 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	CSN1S1	P47710	185 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	PDE6H	Q13956	83 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534		Q6AWC8	147 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	NMES1	Q9C002	83 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534		H0YIZ8	118 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	IL7	P13232	177 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	IL15RA	Q13261	267 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	LELP1	Q5T871	98 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	STX12	Q86Y82	276 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	LRP2	P98164	4655 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	TNXB	P22105	4242 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	CENPX	A8MT69	81 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	PANO1	I0J062	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534		K7EP13	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	TCRB	P04435	133 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	HBG1	P69891	147 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	HBG2	P69892	147 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534		A6NJY4	79 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	LYRM1	O43325	122 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	OXT	P01178	125 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	C1QB	P02746	253 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	ASIP	P42127	132 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	TIRAP	P58753	221 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	RHOH	Q15669	191 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PCNX4-208	ENST00000554534	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71

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