RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 C2orf70A6NJV1 201 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 TEX22C9J3V5 150 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 CFHR4Q92496 578 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 WIPF3A6NGB9 483 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFS7O75251 213 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 PYY3Q5JQD4 70 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 TIMM17AQ99595 171 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 C9JAW5 83 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 K7EP34 96 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGLC2P0DOY2 106 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGLC3P0DOY3 106 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 CTRLP40313 264 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 FREM3P0C091 2139 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 NPC2P61916 151 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 KNTC1P50748 2209 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 RIPPLY3P57055 190 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 CFHR3Q02985 330 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 COX7A2LO14548 114 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1-17P01599 117 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGF1P05019 195 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N7P7 452 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 PIFOQ8TCI5 191 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF747Q9BV97 191 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 OBSL1O75147 1896 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 K7EN84 100 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 CGB3P0DN86 165 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 HIGD1BQ9P298 99 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 CRYBA4P53673 196 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 SLURP1P55000 103 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 Q6YL49 198 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 A0A087WW49 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 LYRM9A8MSI8 78 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 EBI3Q14213 229 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 SEC16AO15027 2179 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFA1O15239 70 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 TOMM6Q96B49 74 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 Q8NA96 180 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF503Q96F45 646 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 PFN2P35080 140 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 FGF6P10767 208 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 COX7B2Q8TF08 81 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf86A6NJI1 115 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 GYPEP15421 78 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 PDE6GP18545 87 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM131Q92545 1883 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PPM0 123 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 GNRH2O43555 120 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 SPINK8P0C7L1 97 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2BP63146 152 aa6.56□□□□□ -1.36
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PTPRB-208ENST00000550358 CFC1P0CG37 223 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 NPSP0C0P6 89 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 P0C879 139 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 TIRAPP58753 221 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 PATE2Q6UY27 113 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0J9YX75 114 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 KNL1Q8NG31 2342 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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