RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	CBLN1	P23435	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	CRIP1	P50238	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	NDUFA6	P56556	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	GZMB	P10144	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	ID1	P41134	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	TFPI2	P48307	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF138	P52744	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RACK1-231	ENST00000514183	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	DEFB1	P60022	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	RAB4B	P61018	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	COX19	Q49B96	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183		A0A1B0GXF2	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183		F6UB75	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	UBE2C	O00762	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	MT-ND6	P03923	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183		K7EQG2	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	APCS	P02743	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	ORM1	P02763	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	CSN3	P07498	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	HOXA5	P20719	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	CAMP	P49913	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	AKR1D1	P51857	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	HBB	P68871	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	PRR9	Q5T870	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183		Q6AWC8	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183		J3KRW8	73 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	GYPE	P15421	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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