RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 F6UZH7 168 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 PET100P0DJ07 73 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP10-1P60331 282 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 TVP23CQ96ET8 276 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PPV4 95 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 TYMSP04818 313 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 CRYGDP07320 174 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 RAB2AP61019 212 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 TREM1Q9NP99 234 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 GNG5P63218 68 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 SGK494Q96LW2 274 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 ASB13Q8WXK3 278 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 KCNS1Q96KK3 526 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 PPT1P50897 306 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 GCSHP23434 173 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 TIRAPP58753 221 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 DEFA1P59665 94 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 DEFA3P59666 94 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 Q5VSD8 79 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 FAT1Q14517 4588 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 ZNF876PQ49A33 203 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 FRZBQ92765 325 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 A6NHS1 94 aa11.36□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 PSCAO43653 123 aa11.36□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 TCRAP04437 139 aa11.36□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.36□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.36□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 TAAR5O14804 337 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 RS1O15537 224 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 STAG3L2P0CL84 134 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 STAG3L3P0CL85 134 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 C5orf17Q8NAS9 161 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 GCGP01275 180 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 RHOHQ15669 191 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 RAB24Q969Q5 203 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 C9orf85Q96MD7 179 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 PSG8Q9UQ74 426 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-211ENST00000513325 K7EQM0 130 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 CIDEAO60543 219 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 IGLV2-11P01706 119 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 GCHFRP30047 84 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 SUN5Q8TC36 379 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 Q9HAA7 133 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-30P01768 117 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-33P01772 117 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V0CP27449 155 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 HAMPP81172 84 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 PRNTQ86SH4 94 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 ALG5Q9Y673 324 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 SMUG1Q53HV7 270 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 LELP1Q5T871 98 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 EPDR1Q9UM22 224 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.31□□□□□ -0.6
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