RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193		M0R2P5	195 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	HIVEP2	P31629	2446 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV1-47	P01700	117 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193		K7ERJ3	54 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV2-23	P01705	113 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CFHR4	Q92496	578 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CTSG	P08311	255 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	DSCR9	P59020	149 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF415	Q09FC8	603 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	RNF223	E7ERA6	249 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193		F8VRH5	84 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193		K7EP13	123 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TEX22	C9J3V5	150 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	AMTN	Q6UX39	209 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf142	B7Z368	130 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFA4	O00483	81 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CCL25	O15444	150 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	GNRH2	O43555	120 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	XCL2	Q9UBD3	114 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	SAP30	O75446	220 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193		C9JAW5	83 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00158	P58513	81 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	PMVK	Q15126	192 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	PRAC2	D3DTV9	90 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	YPEL4	Q96NS1	127 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFS8	O00217	210 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193		H3BMG7	143 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV2-8	P01709	118 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	HLA-DRB4	P13762	266 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TCF15	Q12870	199 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB125	Q8N687	156 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPM0	123 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193		K7EP34	96 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	BUB3	O43684	328 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CRYGC	P07315	174 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	BLCAP	P62952	87 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01545	Q5VT33	79 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CFAP161	Q6P656	301 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf82	Q6UX34	121 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N7P7	452 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	CDKN1B	P46527	198 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE2B	Q13066	116 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE2E	Q4V326	116 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N9W7	124 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	EML5	Q05BV3	1969 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	INS	P01308	110 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	NBL1	P41271	181 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB1	P60022	68 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	ATXN8	Q156A1	80 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	NPB	Q8NG41	125 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NEK1-208	ENST00000512193	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		6.27	□□□□□ -1.41

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