RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TVP23C	Q96ET8	276 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	HSPG2	P98160	4391 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TCL1A	P56279	114 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF415	Q09FC8	603 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZQT7	251 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	PAGE4	O60829	102 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	ATP5G1	P05496	136 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	ATP5G3	P48201	142 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148		Q86TA4	180 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	NAGK	Q9UJ70	344 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2G1	P62253	170 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TDRG1	Q3Y452	100 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	C8orf49	Q96NF6	230 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	GAGE12B	A1L429	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	GAGE7	O76087	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	GCG	P01275	180 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	GAGE12F	P0CL80	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	GAGE12G	P0CL81	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	GAGE12I	P0CL82	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	AKR1C3	P42330	323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	KCNS1	Q96KK3	526 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	RNF212	Q495C1	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZTI0	123 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	SPINK4	O60575	86 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	C18orf15	Q96N68	181 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148		F5H768	121 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	IFNA1	P01562	189 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	TYMS	P04818	313 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	SPX	Q9BT56	116 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	LTA	P01374	205 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	CCL20	P78556	96 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	TNP2	Q05952	138 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
MIB2-223	ENST00000508148	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.58	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	GNRH2	O43555	120 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	BCL2	P10415	239 aa		11.56	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.56	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	OR5I1	Q13606	314 aa		11.56	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.56	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.56	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148		M0R2P5	195 aa		11.55	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	PDE6D	O43924	150 aa		11.55	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	HOXA5	P20719	270 aa		11.55	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		11.55	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	RASL10A	Q92737	203 aa		11.55	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		11.54	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	SH2D1A	O60880	128 aa		11.54	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.54	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.53	□□□□□ -0.56
MIB2-223	ENST00000508148	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		11.53	□□□□□ -0.56

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