RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 KHDC3LQ587J8 217 aa20.21■□□□□ 0.83
ALYREF-202ENST00000505490 OTORQ9NRC9 128 aa20.21■□□□□ 0.83
ALYREF-202ENST00000505490 TVP23CQ96ET8 276 aa20.2■□□□□ 0.82
ALYREF-202ENST00000505490 MARVELD1Q9BSK0 173 aa20.2■□□□□ 0.82
ALYREF-202ENST00000505490 TYMSP04818 313 aa20.19■□□□□ 0.82
ALYREF-202ENST00000505490 TAS2R45P59539 299 aa20.19■□□□□ 0.82
ALYREF-202ENST00000505490 CYCSP99999 105 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa20.19■□□□□ 0.82
ALYREF-202ENST00000505490 FFAR4Q5NUL3 377 aa20.19■□□□□ 0.82
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ALYREF-202ENST00000505490 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa20.18■□□□□ 0.82
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ALYREF-202ENST00000505490 FAM229AH3BQW9 127 aa20.18■□□□□ 0.82
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ALYREF-202ENST00000505490 BOLA1Q9Y3E2 137 aa20.18■□□□□ 0.82
ALYREF-202ENST00000505490 H2BFSP57053 126 aa20.17■□□□□ 0.82
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ALYREF-202ENST00000505490 Q8N814 137 aa20.16■□□□□ 0.82
ALYREF-202ENST00000505490 HYLS1Q96M11 299 aa20.16■□□□□ 0.82
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ALYREF-202ENST00000505490 SLC25A29Q8N8R3 303 aa20.14■□□□□ 0.81
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ALYREF-202ENST00000505490 FAM74A1Q5RGS3 127 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-202ENST00000505490 PQLC2Q6ZP29 291 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-202ENST00000505490 TREM1Q9NP99 234 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-202ENST00000505490 FAM30AQ9NZY2 134 aa20.12■□□□□ 0.81
ALYREF-202ENST00000505490 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-202ENST00000505490 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa20.11■□□□□ 0.81
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ALYREF-202ENST00000505490 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
ALYREF-202ENST00000505490 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa20.1■□□□□ 0.81
ALYREF-202ENST00000505490 F6UZH7 168 aa20.1■□□□□ 0.81
ALYREF-202ENST00000505490 MPC2O95563 127 aa20.1■□□□□ 0.81
ALYREF-202ENST00000505490 CFAP126Q5VTH2 177 aa20.1■□□□□ 0.81
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ALYREF-202ENST00000505490 LELP1Q5T871 98 aa20.09■□□□□ 0.81
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ALYREF-202ENST00000505490 PRADC1Q9BSG0 188 aa20.07■□□□□ 0.8
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ALYREF-202ENST00000505490 RPL12P30050 165 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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ALYREF-202ENST00000505490 SMIM3Q9BZL3 60 aa20.05■□□□□ 0.8
ALYREF-202ENST00000505490 Q9HAA7 133 aa20.05■□□□□ 0.8
ALYREF-202ENST00000505490 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa20.04■□□□□ 0.8
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ALYREF-202ENST00000505490 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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ALYREF-202ENST00000505490 SUN5Q8TC36 379 aa20.03■□□□□ 0.8
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ALYREF-202ENST00000505490 ZNF506Q5JVG8 444 aa20■□□□□ 0.79
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ALYREF-202ENST00000505490 STAG3L2P0CL84 134 aa19.98■□□□□ 0.79
ALYREF-202ENST00000505490 STAG3L3P0CL85 134 aa19.98■□□□□ 0.79
ALYREF-202ENST00000505490 C5orf17Q8NAS9 161 aa19.98■□□□□ 0.79
ALYREF-202ENST00000505490 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa19.97■□□□□ 0.79
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