RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 H3BMG7 143 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 CCL16O15467 120 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 OR1I1O60431 355 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 TPST1O60507 370 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 IGKV2D-28P01615 120 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 CRYGAP11844 174 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 PATE2Q6UY27 113 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 TEX29Q8N6K0 151 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 SLC30A7Q8NEW0 376 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 OR4C6Q8NH72 309 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 AQP3Q92482 292 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ERG28Q9UKR5 140 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 CACNA1DQ01668 2161 aa2.76□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ABCA12Q86UK0 2595 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 MYO9AB2RTY4 2548 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 A0A1B0GVG6 124 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 BBIP1A8MTZ0 92 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 LINC00032P0C843 101 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 SCIMPQ6UWF3 145 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 IZUMO2Q6UXV1 221 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 OR5D16Q8NGK9 328 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 BRK1Q8WUW1 75 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 NAT14Q8WUY8 206 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ZNF714Q96N38 554 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 AP1S3Q96PC3 154 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 CCDC167Q9P0B6 97 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 PATJQ8NI35 1801 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ITPR3Q14573 2671 aa2.75□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 SPTA1P02549 2419 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 FREM2Q5SZK8 3169 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 PTPRDP23468 1912 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 TET1Q8NFU7 2136 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 A0A1W2PNM2 257 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 LOC730098B7Z3J9 87 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 IFNA4P05014 189 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 TSPAN19P0C672 248 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 SPINT3P49223 89 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 EMX2Q04743 252 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 LCN15Q6UWW0 184 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 OR4S1Q8NGB4 309 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 PPP3R2Q96LZ3 170 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 TP53RKQ96S44 253 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 LPAR5Q9H1C0 372 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 CCL26Q9Y258 94 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa2.74□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ODF3BA8MYP8 253 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 RER1O15258 196 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 AQP4P55087 323 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 NCS1P62166 190 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 RPS25P62851 125 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 SELENOWP63302 87 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 DEFB134Q4QY38 66 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 Q6ZQT0 140 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ARPINQ7Z6K5 226 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 OR5A2Q8NGI9 324 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 OR4K15Q8NH41 348 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 CYYR1Q96J86 154 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 Q9H521 79 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 BCL2L10Q9HD36 194 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 AP4S1Q9Y587 144 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 A8MWV9 139 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 C5orf67F2Z3F1 127 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 F8W036 122 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 G3V3Q6 166 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 J3QR89 54 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 FXYD1O00168 92 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 IGLC6P0CF74 106 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 CRYGSP22914 178 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 S100A3P33764 101 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 RPL38P63173 70 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 RELAQ04206 551 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 NNATQ16517 81 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 LY6EQ16553 131 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 TAF9Q16594 264 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 398.4 ms