RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 EBI3Q14213 229 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TM4SF20Q53R12 229 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPM0 123 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 LY6EQ16553 131 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 C8orf49Q96NF6 230 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ZANQ9Y493 2812 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ZNF785A8K8V0 405 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 MSMBP08118 114 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 RNF152Q8N8N0 203 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 Q8TAT8 98 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 HBBP68871 147 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 WFDC2Q14508 124 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 Q6YL49 198 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 RABAC1Q9UI14 185 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 M0QXV9 152 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CHEK1O14757 476 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ERG28Q9UKR5 140 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 LEPROTL1O95214 131 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CSN3P07498 182 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CSN1S1P47710 185 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CRIP1P50238 77 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ZNF492Q9P255 531 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GXF2 115 aa5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 CT45A10P0DMU9 189 aa5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ZNF138P52744 262 aa5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SPATA25Q9BR10 227 aa5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.4□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GWB2 263 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 RNF182Q8N6D2 247 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SYT8Q8NBV8 401 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 VGLL1Q99990 258 aa5.39□□□□□ -1.55
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HERC4-211ENST00000492996 MT-ATP8P03928 68 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 CCDC140Q96MF4 163 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 C20orf78Q9BR46 151 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 VCX2Q9H322 139 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 A4D1N5 150 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SMIM13P0DJ93 91 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GCSHP23434 173 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 RASL11AQ6T310 242 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 MDFIQ99750 246 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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HERC4-211ENST00000492996 IGHV1-69P01742 117 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ERCC8Q13216 396 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GUT8 65 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 PRAC2D3DTV9 90 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-11P01762 117 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 INSL3P51460 131 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 CT83Q5H943 113 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 C2orf70A6NJV1 201 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 H3BUX3 64 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 PDE6HQ13956 83 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 PIFOQ8TCI5 191 aa5.38□□□□□ -1.55
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