RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488944.5

WDR46-238, Transcript of WD repeat domain 46, humanhuman

TSL 3

Gene WDR46, Length 538 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46-238ENST00000488944 TAS2R45P59539 299 aa8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 IFITM3Q01628 133 aa8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 TDRG1Q3Y452 100 aa8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 FRZBQ92765 325 aa8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 TVP23CQ96ET8 276 aa8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 OTORQ9NRC9 128 aa8.69□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 M0R2P5 195 aa8.68□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 MPC2O95563 127 aa8.68□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 DEFA1P59665 94 aa8.68□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 DEFA3P59666 94 aa8.68□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 GNG5P63218 68 aa8.68□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 TMED6Q8WW62 240 aa8.68□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 SGK494Q96LW2 274 aa8.68□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 MBD2Q9UBB5 411 aa8.68□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 K7EP13 123 aa8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 GCSHP23434 173 aa8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 PPT1P50897 306 aa8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 RAB2AP61019 212 aa8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 WFDC1Q9HC57 220 aa8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 TREM1Q9NP99 234 aa8.67□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.66□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 PSCAO43653 123 aa8.66□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 SSNA1O43805 119 aa8.66□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.66□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.66□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 Q9HAA7 133 aa8.66□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.66□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.65□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 A0A1W2PPV4 95 aa8.65□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.65□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 RGS21Q2M5E4 152 aa8.65□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.65□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.65□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.65□□□□□ -1.02
WDR46-238ENST00000488944 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 PTTG1O95997 202 aa8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 PET100P0DJ07 73 aa8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 ASB13Q8WXK3 278 aa8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 KCNS1Q96KK3 526 aa8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.64□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 MYCBP2O75592 4640 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 IGHV3-30P01768 117 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 IGHV3-33P01772 117 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 TIRAPP58753 221 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 ZNF876PQ49A33 203 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.62□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.62□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 RS1O15537 224 aa8.62□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.62□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.62□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.62□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.61□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 GCGP01275 180 aa8.61□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 RHOHQ15669 191 aa8.61□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.61□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 Q8N3U1 123 aa8.61□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 Q8N814 137 aa8.61□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.61□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 FAM229AH3BQW9 127 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 TCRAP04437 139 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 STAG3L2P0CL84 134 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 STAG3L3P0CL85 134 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 WFDC2Q14508 124 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 LELP1Q5T871 98 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 C9orf85Q96MD7 179 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 PSG8Q9UQ74 426 aa8.6□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 TAAR5O14804 337 aa8.59□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
WDR46-238ENST00000488944 GCHFRP30047 84 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms