RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00479	Q96M42	142 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	PEX7	O00628	323 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	TYMS	P04818	313 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	SFTA3	P0C7M3	94 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	SPX	Q9BT56	116 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880		A0A096LPF7	62 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	FAM74A7	A6NL05	159 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880		C9JCJ5	164 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2G1	P62253	170 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	TMUB2	Q71RG4	321 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	MUC4	Q99102	2169 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	SEC11B	P0C7V7	166 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	C18orf15	Q96N68	181 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	UMAD1	C9J7I0	102 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880		M0R2P5	195 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV2-11	P01706	119 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	TDRG1	Q3Y452	100 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF479	Q96JC4	524 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	PRO0255	Q9UI72	69 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880		H3BNG1	76 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	PAGE4	O60829	102 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	AKR1C3	P42330	323 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	SLA	Q13239	276 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	FHL2	Q14192	279 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	ESRG	Q1W209	222 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880		Q86TA4	180 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH2	Q9P225	4427 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SSR4-208	ENST00000471880	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	ORM1	P02763	201 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	CRYBA4	P53673	196 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZR54	194 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880		Q9H8V8	135 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	RTL8C	O15255	209 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF876P	Q49A33	203 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	RASL10A	Q92737	203 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880		M0R036	132 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	GYPE	P15421	78 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	SRI	P30626	198 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	FMC1	Q96HJ9	113 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880		B4DEV8	164 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	ASIP	P42127	132 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	TTC32	Q5I0X7	151 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	AKAP14	Q86UN6	197 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf223	Q8N319	242 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	GNG13	Q9P2W3	67 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	TEX46	H3BTG2	121 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	SH2D1A	O60880	128 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	NXPH4	O95158	308 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZNX1	250 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		10.21	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms