RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-208	ENST00000468310	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	HSPG2	P98160	4391 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310		C9JCJ5	164 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	TYMS	P04818	313 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	ERVFC1-1	P60608	527 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	NFE4	Q86UQ8	179 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	SGK494	Q96LW2	274 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	KCNS1	Q96KK3	526 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PRKCZ-208	ENST00000468310	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	ASB13	Q8WXK3	278 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	STAG3L2	P0CL84	134 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	STAG3L3	P0CL85	134 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	EVI2A	P22794	236 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310		Q8N1X5	172 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	MED28	Q9H204	178 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310		K7EQM0	130 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	RAB24	Q969Q5	203 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	MB	P02144	154 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	TCRA	P04437	139 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	ATP6V0C	P27449	155 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	GCHFR	P30047	84 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	AQP10	Q96PS8	301 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310		K7EP13	123 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	14.6	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	BATF3	Q9NR55	127 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	PTTG1	O95997	202 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	PPT1	P50897	306 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	SERF2	P84101	59 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZFP69	Q49AA0	526 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	PSG8	Q9UQ74	426 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PRKCZ-208	ENST00000468310	TAAR5	O14804	337 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	CXorf1	O96002	111 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	GCG	P01275	180 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF876P	Q49A33	203 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	SUN5	Q8TC36	379 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	CRYGD	P07320	174 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRNT	Q86SH4	94 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	EPDR1	Q9UM22	224 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310		A0A087WTM6	91 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	GGTLC3	B5MD39	225 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	SMUG1	Q53HV7	270 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGLV2-11	P01706	119 aa		14.55	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310		Q5BKY6	102 aa		14.55	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		14.55	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		14.55	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	RS1	O15537	224 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	CIDEA	O60543	219 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	TIRAP	P58753	221 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	RHOH	Q15669	191 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	C9orf85	Q96MD7	179 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-208	ENST00000468310	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310		A0A1W2PRE2	83 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	PSCA	O43653	123 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	IFNA7	P01567	189 aa		14.5	□□□□□ -0.09

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