RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465147.1

SEMA5B-208, Transcript of semaphorin 5B, human

TSL 3

Gene SEMA5B, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA5B-208	ENST00000465147	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	ALG5	Q9Y673	324 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147		A0A087WTM6	91 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	XG	P55808	180 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	DEFA1	P59665	94 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	DEFA3	P59666	94 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	KRTAP10-1	P60331	282 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	ORM1	P02763	201 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147		Q5BKY6	102 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	IGLV2-11	P01706	119 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147		C9JCJ5	164 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SEMA5B-208	ENST00000465147	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	TCRA	P04437	139 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	GCHFR	P30047	84 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	CRYGD	P07320	174 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	EVI2A	P22794	236 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	PSG8	Q9UQ74	426 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	FAT1	Q14517	4588 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	EREG	O14944	169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	RS1	O15537	224 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	ZNF876P	Q49A33	203 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	GCG	P01275	180 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147		Q6ZSN1	163 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	PRNT	Q86SH4	94 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	EPM2A	B3EWF7	344 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	TIRAP	P58753	221 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	HAMP	P81172	84 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	PPT1	P50897	306 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147		Q8N3U1	123 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147		Q9UF83	564 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SEMA5B-208	ENST00000465147	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147		K7EP13	123 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	TAAR5	O14804	337 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	MED28	Q9H204	178 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	IGHV3-30	P01768	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	IGHV3-33	P01772	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	CXorf1	O96002	111 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	SERF2	P84101	59 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	SMUG1	Q53HV7	270 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SEMA5B-208	ENST00000465147	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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