RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450375.5

PARL-208, Transcript of presenilin associated rhomboid like, human

TSL 2

Gene PARL, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARL-208	ENST00000450375	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	PRO0255	Q9UI72	69 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375		A0A096LPF7	62 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	RNF222	A6NCQ9	220 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375		F6UZH7	168 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	ZFP69	Q49AA0	526 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	KCNS1	Q96KK3	526 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	SGK494	Q96LW2	274 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	C8orf49	Q96NF6	230 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	UPK3B	Q9BT76	320 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PARL-208	ENST00000450375	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TCRA	P04437	139 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	FHL2	Q14192	279 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TDRG1	Q3Y452	100 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	SUN5	Q8TC36	379 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	HERC2	O95714	4834 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375		A0A1W2PPQ1	181 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375		M0R2P5	195 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TAAR5	O14804	337 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	ARPC5	O15511	151 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	GNRH2	O43555	120 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	IFNA7	P01567	189 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TYMS	P04818	313 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	SFTA3	P0C7M3	94 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	CRYBA4	P53673	196 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	RASL10A	Q92737	203 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TVP23C	Q96ET8	276 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	ZNF479	Q96JC4	524 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	EPDR1	Q9UM22	224 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	PSG8	Q9UQ74	426 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375		A0A1W2PRE2	83 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	GGTLC3	B5MD39	225 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	SIVA1	O15304	175 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	NXPH4	O95158	308 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	GCG	P01275	180 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	MED14OS	P0DP75	135 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	SRI	P30626	198 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	PPT1	P50897	306 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	UBE2G2	P60604	165 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	SMUG1	Q53HV7	270 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375		C9JCJ5	164 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	ORM1	P02763	201 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	GYPE	P15421	78 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375		K7EQD1	137 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	ZNF726P1	Q15940	193 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	ZNF575	Q86XF7	245 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	STOML3	Q8TAV4	291 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	C16orf90	A8MZG2	172 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375		G3V3Q6	166 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	SMLR1	H3BR10	107 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	PEX7	O00628	323 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	IGLV2-11	P01706	119 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	ZNF876P	Q49A33	203 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PARL-208	ENST00000450375	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PARL-208	ENST00000450375	FAM74A7	A6NL05	159 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PARL-208	ENST00000450375	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PARL-208	ENST00000450375	CIDEA	O60543	219 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PARL-208	ENST00000450375	LINC00315	P59091	139 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PARL-208	ENST00000450375	UBE2G1	P62253	170 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PARL-208	ENST00000450375	ZNF345	Q14585	488 aa		6.21	□□□□□ -1.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms