RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HDLBP-222	ENST00000449504	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HDLBP-222	ENST00000449504	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HDLBP-222	ENST00000449504	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HDLBP-222	ENST00000449504	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HDLBP-222	ENST00000449504	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HDLBP-222	ENST00000449504	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	CTDSPL	O15194	276 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	MPDU1	O75352	247 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	MB	P02144	154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	IAPP	P10997	89 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	IL18	Q14116	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF345	Q14585	488 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A1B0GV90	55 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC17A3	O00476	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SSNA1	O43805	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4E1	P0C645	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	S100A2	P29034	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	ERCC8	Q13216	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	LAGE3	Q14657	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	COLCA2	A8K830	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504		G3V3Q6	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	CD3D	P04234	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	GPX1	P07203	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00869	P0C866	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	CXCL2	P19875	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	DDT	P30046	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	CCR6	P51684	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	TIRAP	P58753	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504		Q6ZQT7	251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A0U1RQV1	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	HOXB5	P09067	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	AKR1C4	P17516	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	BTC	P35070	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	KLLN	B2CW77	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	RMI2	Q96E14	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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