RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 ATG2BQ96BY7 2078 aa2.77□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 IRGMA1A4Y4 181 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 C7orf71A4D174 169 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 LY6LH3BQJ8 138 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 NPFFO15130 113 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLC6P0CF74 106 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 FABP4P15090 132 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 CD24P25063 80 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 COL8A2P25067 703 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-DMBP28068 263 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 XCL1P47992 114 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF141Q15928 474 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 MIAQ16674 131 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4C12Q96R67 309 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 SDF2Q99470 211 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 PKMYT1Q99640 499 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 BET1LQ9NYM9 111 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 TAS2R8Q9NYW2 309 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 MED31Q9Y3C7 131 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 APC2O95996 2303 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 MYLKQ15746 1914 aa2.76□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 NOTCH2Q04721 2471 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0D9SG52 128 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM235A6NFC5 223 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 FNDC10F2Z333 226 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BPC8 53 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 J3QR89 54 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC42EP2O14613 210 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 GPX1P07203 203 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 SPINK8P0C7L1 97 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 NFYBP25208 207 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 CATR1Q13166 79 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 EBI3Q14213 229 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 HEPN1Q6WQI6 88 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 LYPD6Q86Y78 171 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 OR52R1Q8NGF1 315 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5C1Q8NGR4 320 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 C10orf82Q8WW14 230 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 TSLPQ969D9 159 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 GINS4Q9BRT9 223 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 CREBBPQ92793 2442 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 POLQO75417 2590 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ACACAQ13085 2346 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 LRBAP50851 2863 aa2.75□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0J9YW62 118 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PQD3 144 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ODAMA1E959 279 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 G3V3Q6 166 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BQ15 152 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 OVOL1O14753 267 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 TAX1BP3O14907 124 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H2BKO60814 126 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 SIX6O95475 246 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV2D-28P01615 120 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV3-7P01780 117 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H2BJP06899 126 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 RRN3P1Q2M238 152 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 OR51T1Q8NGJ9 327 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 CYYR1Q96J86 154 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 OR8B2Q96RD0 313 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 ATG5Q9H1Y0 275 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 NPVFQ9HCQ7 196 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 RPRMQ9NS64 109 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 PCTPQ9UKL6 214 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 NF1P21359 2839 aa2.74□□□□□ -1.97
CBX1P4-201ENST00000439415 CACNA1EQ15878 2313 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms