RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 PTH2Q96A98 100 aa11.86□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.86□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.86□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 SMPXQ9UHP9 88 aa11.86□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 H3BVH4 76 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 NDUFS8O00217 210 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 NRACQ8N912 160 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 A0A1B0GV72 72 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 APOMO95445 188 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 EMP1P54849 157 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 ECSCRQ19T08 205 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 LINC01548A6NM66 108 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 IGF1P05019 195 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 CLEC3BP05452 202 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 GLMPQ8WWB7 406 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 PRO0461Q9UI25 63 aa11.85□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 OR11H12B2RN74 326 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 HLA-DRB4P13762 266 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 UCNP55089 124 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 LINC01559Q495D7 138 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 OR11H1Q8NG94 326 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 OR11H2Q8NH07 326 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 CENPEQ02224 2701 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 LINC01546A6NGU7 62 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 M0R381 172 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 PSMB2P49721 201 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 DEFB1P60022 68 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 RNF5Q99942 180 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 CNFNQ9BYD5 112 aa11.84□□□□□ -0.51
SFRP4-201ENST00000436072 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SYT8Q8NBV8 401 aa11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SPATA25Q9BR10 227 aa11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 LINC01549A6NIU2 74 aa11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.83□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 C15orf32Q32M92 178 aa11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 NPBQ8NG41 125 aa11.82□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 H7C1H1 209 aa11.81□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SCGB1A1P11684 91 aa11.81□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.81□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 ACACBO00763 2458 aa11.81□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 NFE4Q86UQ8 179 aa11.81□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.81□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.81□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.8□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 CACNA1AO00555 2505 aa11.8□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 PLNP26678 52 aa11.8□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF815PA8K554 130 aa11.8□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 F8VRH5 84 aa11.8□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 MGPP08493 103 aa11.8□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 PRR9Q5T870 116 aa11.8□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.8□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 A0A1W2PPR1 153 aa11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 BUB3O43684 328 aa11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SLC25A16P16260 332 aa11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 MT-ATP8P03928 68 aa11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 TAL2Q16559 108 aa11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 PSMG4Q5JS54 123 aa11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 FOXI1Q12951 378 aa11.79□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.78□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 G3V318 75 aa11.78□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 FHL3Q13643 280 aa11.78□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.78□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.78□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.78□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SPINK8P0C7L1 97 aa11.77□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.77□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
SFRP4-201ENST00000436072 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 TIMD4Q96H15 378 aa11.77□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 CRYBA4P53673 196 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms