RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.02□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.02□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.02□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.02□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CT45A10P0DMU9 189 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EDN2P20800 178 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ID1P41134 155 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF138P52744 262 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMUG1Q53HV7 270 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUP35Q8NFH5 326 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C8orf49Q96NF6 230 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEU1Q99519 415 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PEMTQ9UBM1 199 aa7.01□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C5orf52A6NGY3 159 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIGD1CA8MV81 97 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 K7EQG2 157 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H2BKO60814 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SH2D1AO60880 128 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MT-ND6P03923 174 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H2BJP06899 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H2BOP23527 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H2BBP33778 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H2BDP58876 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H2BCP62807 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ERCC8Q13216 396 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST2H2BEQ16778 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM78Q5T7P6 136 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6AWC8 147 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WDR73Q6P4I2 378 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 APRG1Q8IVJ8 170 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZFP82Q8N141 532 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF738Q8NE65 137 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2D3Q8NGH3 330 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q8TAT8 98 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GTSF1Q8WW33 167 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FRZBQ92765 325 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H2BHQ93079 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM19A4Q96LR4 140 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H2BNQ99877 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H2BMQ99879 126 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GXF2 115 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV1-51P01701 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSN3P07498 182 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRGC1P0CF51 173 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.99□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0J9YWU9 116 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XKRY2A2RUG3 117 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2CO00762 179 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HLA-DQA1P01909 254 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 S100A6P06703 90 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRISP2P16562 243 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCL1AP56279 114 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GATD1Q8NB37 220 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ODF3Q96PU9 254 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.98□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GW15 77 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM189A5PLL7 270 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HOXA5P20719 270 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAFAH1B2P68402 229 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.97□□□□□ -1.29
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A8MTW9 85 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNURFLB1AK76 121 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLC6P0CF74 106 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HBBP68871 147 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q8N1X5 172 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.96□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.95□□□□□ -1.3
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0J9YX75 114 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms