RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411355.1

RNU6-954P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 954, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-954P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-954P-201ENST00000411355 RNF185Q96GF1 192 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TIMD4Q96H15 378 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 SIGMAR1Q99720 223 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 DPM3Q9P2X0 92 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 HHLA3Q9XRX5 114 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 NCOR1O75376 2440 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF318Q5VUA4 2279 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A087WX48 190 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A1W2PRD5 423 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A1W2PRF3 423 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A1W2PRM7 423 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 ODF3BA8MYP8 253 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR11H12B2RN74 326 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGLL5B9A064 214 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 F8VRH5 84 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 H7C1H1 209 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 M0QXV9 152 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 M0R381 172 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 M0R3E3 92 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 SNAI2O43623 268 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 CLEC3BP05452 202 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRSS1P07477 247 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM106CPP0CH98 169 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 SRD5A1P18405 259 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 CNTFRP26992 372 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 RPL24P83731 157 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 EBI3Q14213 229 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 RRN3P1Q2M238 152 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM106AQ4KMX7 169 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 LYPD2Q6UXB3 125 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 GFRALQ6UXV0 394 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCP2Q8IVA1 136 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 Q8N6K4 173 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRSS33Q8NF86 280 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR11H1Q8NG94 326 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR11H2Q8NH07 326 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 SVIPQ8NHG7 77 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 C20orf78Q9BR46 151 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 HILPDAQ9Y5L2 63 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRIOO75962 3097 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 ABCA1O95477 2261 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 E7EQL1 145 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 H3BMG7 143 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 GAGE7O76087 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 GOSR1O95249 250 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 ORM1P02763 201 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 GAGE12FP0CL80 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 GAGE12GP0CL81 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 GAGE12IP0CL82 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM11P17152 192 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRTN3P24158 256 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 FXYD2P54710 66 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 RIPPLY3P57055 190 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TCTAP57738 103 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 GAGE4Q13068 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 C12orf74Q32Q52 190 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 C14orf177Q52M58 125 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM78Q5T7P6 136 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM158Q8WZ71 300 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 RAB37Q96AX2 223 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 C17orf77Q96MU5 243 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 HIST1H4GQ99525 98 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 FOXC2Q99958 501 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 SMIM2Q9BVW6 85 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 XIRP2A4UGR9 3374 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 LAMA1P25391 3075 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 SZT2Q5T011 3432 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms