RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DEFB113Q30KQ7 82 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC48A1Q6P1K1 146 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LINC00612Q8N6U2 182 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 OR8B3Q8NGG8 313 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AMELYQ99218 206 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CACFD1Q9UGQ2 172 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 S4R3C0 116 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYO10Q9HD67 2058 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WDR90Q96KV7 1748 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PTPRSQ13332 1948 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLXNA3P51805 1871 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PARP14Q460N5 1801 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRAV10A0A0B4J240 114 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 A0A1W2PPM0 123 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ERC2-IT1O76042 136 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ASAH2BP0C7U1 165 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MIFP14174 115 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MIR22HGQ0VDD5 57 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF79Q15937 498 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ETDBQ3ZM63 59 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SERP2Q8N6R1 65 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C9orf106Q8NAJ2 232 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYOZ3Q8TDC0 251 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KLK12Q9UKR0 248 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NLRP1Q9C000 1473 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GREB1Q4ZG55 1949 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 USP54Q70EL1 1684 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DAPK1P53355 1430 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EEA1Q15075 1411 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRPM6Q9BX84 2022 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MEGF6O75095 1541 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ODF3BA8MYP8 253 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCL16O15467 120 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TFF1P04155 84 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IGKV3-11P04433 115 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HMGA2P52926 109 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WFDC2Q14508 124 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CLECL1Q8IZS7 167 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 Q8TAT8 98 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CMTM2Q8TAZ6 248 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRGV9Q99603 122 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SBF2Q86WG5 1849 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SCN1AP35498 2009 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HEATR5AQ86XA9 2040 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MON2Q7Z3U7 1717 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HCG22E2RYF7 251 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NDUFC1O43677 76 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 P0C880 135 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CXCL8P10145 99 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NDPQ00604 133 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HMGN3Q15651 99 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LINC00483Q53H64 154 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NMSQ5H8A3 153 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HEPN1Q6WQI6 88 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HIGD2AQ9BW72 106 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NDUFB11Q9NX14 153 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ANKARQ7Z5J8 1434 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYLKQ15746 1914 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DIP2BQ9P265 1576 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa1.96□□□□□ -2.09
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LCTP09848 1927 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
RNU6-1077P-201ENST00000410506 H3BUT2 72 aa1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms