RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 F6UB75 175 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 H3BMM0 161 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BKO60814 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 SAP30O75446 220 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BJP06899 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 OR5AL1P0C617 328 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 TRGC1P0CF51 173 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BOP23527 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BBP33778 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 CDKN1BP46527 198 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BDP58876 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BCP62807 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 CACNG7P62955 275 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF747Q9BV97 191 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 C7orf71A4D174 169 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf52A6NGY3 159 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 SNAI2O43623 268 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 APCSP02743 223 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TDRG1Q3Y452 100 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP82Q8N141 532 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 OR11H12B2RN74 326 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 SPINK4O60575 86 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 GZMBP10144 247 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 RAB4BP61018 213 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 Q0VG73 95 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 AMTNQ6UX39 209 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF575Q86XF7 245 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2CO00762 179 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 CD33P20138 364 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 HOXA5P20719 270 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 ASIPP42127 132 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 PRR9Q5T870 116 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 CAMPP49913 170 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFA6P56556 154 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB1P60022 68 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 STHQ8IWL8 128 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 KNCNA6PVL3 124 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TPPP3Q9BW30 176 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 PPBPP02775 128 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 NTF3P20783 257 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 SLAQ13239 276 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TWIST1Q15672 202 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 J3KRW8 73 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-202ENST00000409024 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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