RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408953.3

ZBED8-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED8, Length 2,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF502Q8TBZ5 544 aa10.15□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SCGB3A1Q96QR1 104 aa10.15□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 ZFHX3Q15911 3703 aa10.14□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 ATP6V0BQ99437 205 aa10.14□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.14□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.14□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 NDUFS8O00217 210 aa10.14□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PRR9Q5T870 116 aa10.14□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 Q8N6K4 173 aa10.14□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 M0R381 172 aa10.13□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SLC50A1Q9BRV3 221 aa10.13□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.13□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa10.13□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.13□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 G3V318 75 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 APOMO95445 188 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 Q8N9W7 124 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 RAXQ9Y2V3 346 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 A0A1B0GV72 72 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 LINC01548A6NM66 108 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SCGB2A2Q13296 93 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 CCDC140Q96MF4 163 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 VKORC1Q9BQB6 163 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 RASL10AQ92737 203 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.12□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 LINC01549A6NIU2 74 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 FAM90A27PA6NNH2 459 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 M0R1W7 72 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 ATP6V0E1O15342 81 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 RAB9AP51151 201 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 DEFB1P60022 68 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 Q5PR19 223 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 TOMM6Q96B49 74 aa10.11□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF815PA8K554 130 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 CKS1BP61024 79 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 AKAP6Q13023 2319 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SLC25A16P16260 332 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 FOXI1Q12951 378 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 C2orf66Q6UXQ4 117 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 NFE4Q86UQ8 179 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 BAALCQ8WXS3 180 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PTH2Q96A98 100 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 MRAP2Q96G30 205 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 HIF1ANQ9NWT6 349 aa10.1□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PSMB2P49721 201 aa10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 EMP1P54849 157 aa10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 ORMDL2Q53FV1 153 aa10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 SYT8Q8NBV8 401 aa10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 TIMD4Q96H15 378 aa10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 EBI3Q14213 229 aa10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ZBED8-201ENST00000408953 MGPP08493 103 aa10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 C16orf92Q96LL3 132 aa10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 C20orf173Q96LM9 149 aa10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 METTL26Q96S19 204 aa10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 LINC01619G3V211 115 aa10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 GLMPQ8WWB7 406 aa10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa10.08□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 TSPAN13O95857 204 aa10.07□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 FHL3Q13643 280 aa10.07□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 CDIP1Q9H305 208 aa10.07□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 RNF223E7ERA6 249 aa10.07□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.07□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 TGFAP01135 160 aa10.06□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.06□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.06□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 COX6B1P14854 86 aa10.05□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 UBE2D1P51668 147 aa10.05□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 CDSNQ15517 529 aa10.05□□□□□ -0.8
ZBED8-201ENST00000408953 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms