RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 MSMBP08118 114 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 PCP2Q8IVA1 136 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB125Q8N687 156 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 C20orf78Q9BR46 151 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 NOTCH2Q04721 2471 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 F8VRH5 84 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFA4O00483 81 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 CARD19Q96LW7 228 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 NXPH4O95158 308 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZR03 302 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 KNCNA6PVL3 124 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 GAGE7O76087 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 GAGE12FP0CL80 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 GAGE12GP0CL81 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 GAGE12IP0CL82 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF134P52741 427 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ZMAT4Q9H898 229 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 PRR25Q96S07 402 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF747Q9BV97 191 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 SIVA1O15304 175 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFS7O75251 213 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 HERV-K104P63124 156 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 RHOHQ15669 191 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 UTRNP46939 3433 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 LY6DQ14210 128 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 CEND1Q8N111 149 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 PRR20EP86478 221 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 PRR20CP86479 221 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 PRR20DP86480 221 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 PRR20BP86481 221 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 PRR20AP86496 221 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JNJ9 132 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 GAGE6Q13070 117 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 FXYD5Q96DB9 178 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 Q9UFV3 132 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 CACNA1AO00555 2505 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 B5MCH6 92 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 C12orf74Q32Q52 190 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 J3QQQ9 107 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 COL8A2P25067 703 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 GATA4P43694 442 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 C5orf47Q569G3 176 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 F6UB75 175 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ELANEP08246 267 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 H0YGX0 51 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV1-69P01742 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ALPK3Q96L96 1907 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV1-44P01699 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 CRYBA4P53673 196 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRM-202ENST00000400053 ACACBO00763 2458 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 C15orf65H3BRN8 121 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 CRYGCP07315 174 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 GNLYP22749 145 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SHISA9B4DS77 424 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 H3BUA1 57 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GX51 115 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 CFHR4Q92496 578 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 C17orf77Q96MU5 243 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6V0E1O15342 81 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 Q8TCH9 128 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 RS1O15537 224 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.01□□□□□ -1.29
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