RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 PAX4O43316 350 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV2-11P01706 119 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB5CP51148 216 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TMUB2Q71RG4 321 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 SSX7Q7RTT5 188 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PRNTQ86SH4 94 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PTH2Q96A98 100 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 MDFICQ9P1T7 246 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 NAGKQ9UJ70 344 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.93□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0J9YY99 117 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TEX46H3BTG2 121 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PEX7O00628 323 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 GCGP01275 180 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ORM1P02763 201 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2G2P60604 165 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TTC32Q5I0X7 151 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZQT7 251 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 FMC1Q96HJ9 113 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 UPK3BQ9BT76 320 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.92□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PPQ1 181 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 M0R2N4 97 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 GNRH2O43555 120 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TYMSP04818 313 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 CRYBA4P53673 196 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2G1P62253 170 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 FHL2Q14192 279 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 CST9LP1Q5W188 147 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZNX1 250 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 SGK494Q96LW2 274 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 Q9H8V8 135 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.91□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.9□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A096LPF7 62 aa5.9□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.9□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 ESRGQ1W209 222 aa5.9□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 C8orf49Q96NF6 230 aa5.9□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.9□□□□□ -1.46
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 C9JCJ5 164 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 K7EP13 123 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 PAGE4O60829 102 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-53P01767 116 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 C1QBP02746 253 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 AKR1C3P42330 323 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF876PQ49A33 203 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 DNLZQ5SXM8 178 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 Q86TA4 180 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF479Q96JC4 524 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00479Q96M42 142 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 C9orf85Q96MD7 179 aa5.89□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 A8MWV9 139 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 RTL8CO15255 209 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 RS1O15537 224 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 LTAP01374 205 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 SRIP30626 198 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 ASIPP42127 132 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC51BQ86UW2 128 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 MANBALQ9NQG1 85 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 IL36BQ9NZH7 164 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.88□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.87□□□□□ -1.47
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.87□□□□□ -1.47
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