RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q9HAA7 133 aa8.71□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 NAGKQ9UJ70 344 aa8.71□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 LELP1Q5T871 98 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q6ZSA8 131 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 KCNS1Q96KK3 526 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 OTORQ9NRC9 128 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PGPA6NDG6 321 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 H0YIZ8 118 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TYMSP04818 313 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TAS2R45P59539 299 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 LAGE3Q14657 143 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 KHDC3LQ587J8 217 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TVP23CQ96ET8 276 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 HYLS1Q96M11 299 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATP5SQ99766 215 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TM2D2Q9BX73 214 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 NMES1Q9C002 83 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 RS1O15537 224 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SIX6O95475 246 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGHV3-30P01768 117 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGHV3-33P01772 117 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 RHOHQ15669 191 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF876PQ49A33 203 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 TREM1Q9NP99 234 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 MBD2Q9UBB5 411 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 ASB13Q8WXK3 278 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCDC32Q9BV29 185 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 WFDC2Q14508 124 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.66□□□□□ -1.02
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TRAPPC3-201ENST00000373159 PTH2Q96A98 100 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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TRAPPC3-201ENST00000373159 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 F6UZH7 168 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 TAAR5O14804 337 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 ASAH1Q13510 395 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 TOR2AQ5JU69 321 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 C9orf85Q96MD7 179 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 HSPB11Q9Y547 144 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PPV4 95 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 GNG5P63218 68 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q8N3U1 123 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 COX11Q9Y6N1 276 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 LECT2O14960 151 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 H2BFSP57053 126 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 SGK494Q96LW2 274 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 GGTLC3B5MD39 225 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 MPC2O95563 127 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 TCRAP04437 139 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC00694P0DN24 101 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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