RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369838.5

SH3BGRL2-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL2, Length 4,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GAGE6Q13070 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SS18Q15532 418 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF815PA8K554 130 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FNDC10F2Z333 226 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RITA1Q96K30 269 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ADAMTS20P59510 1910 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM213A2RRL7 107 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FOXE3Q13461 319 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 Q8N7P7 452 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TYMSP04818 313 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 Q8N9W7 124 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SPRY2O43597 315 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LMO4P61968 165 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DEFB4AO15263 64 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C17orf77Q96MU5 243 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 YPEL4Q96NS1 127 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SPXQ9BT56 116 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 A0A087WW49 117 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRR25Q96S07 402 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 VWC2Q2TAL6 325 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EREGO14944 169 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DDTP30046 118 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ATP6V0BQ99437 205 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 H3BUA1 57 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SEC11AP67812 179 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DEFB135Q30KP9 77 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 A8MWV9 139 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 POU2AF1Q16633 256 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 A0A1B0GV72 72 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 VWC2LB2RUY7 222 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 H3BRN7 92 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGLV2-14P01704 120 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GGTLC3B5MD39 225 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGKCP01834 107 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PLP1P60201 277 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGLV1-47P01700 117 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RASL10AQ92737 203 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 U3KQE9 123 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 H3BMM0 161 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UBE2WQ96B02 151 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NCKAP5O14513 1909 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 A0A1B0GV90 55 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PFN2P35080 140 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GATD1Q8NB37 220 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NXPH4O95158 308 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM243Q9BU79 118 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GNRH2O43555 120 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TNFRSF6BO95407 300 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SIRPDQ9H106 197 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGKV1-17P01599 117 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BGRL2-201ENST00000369838 K7EIM0 57 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CTSGP08311 255 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.4□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms