RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318023.11

CAPN3-201, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPN3, Length 3,172 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-201ENST00000318023 DSCR9P59020 149 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TMEM213A2RRL7 107 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 OOEPA6NGQ2 149 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TMEM178BH3BS89 294 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 AVPP01185 164 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 IGKCP01834 107 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 LMO4P61968 165 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 EDDM3AQ14507 147 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 PRNTQ86SH4 94 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 LEAP2Q969E1 77 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 COQ2Q96H96 371 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 SPXQ9BT56 116 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 LINC01549A6NIU2 74 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 S1PR3Q99500 378 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 GNG12Q9UBI6 72 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 RIGQ13278 110 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 PATE2Q6UY27 113 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 RNF7Q9UBF6 113 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 FCN3O75636 299 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 MSMBP08118 114 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 UTF1Q5T230 341 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 NPIPB3Q92617 1050 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 ZNF492Q9P255 531 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 METRNQ9UJH8 293 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 SPINT2O43291 252 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 NPYP01303 97 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 ORM2P19652 201 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 C5orf47Q569G3 176 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 B4DSR2 109 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 MYCNOSP40205 109 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 ORMDL3Q8N138 153 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 PKIBQ9C010 78 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 PRNDQ9UKY0 176 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 A8MWV9 139 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 PAX8Q06710 450 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 RPEQ96AT9 228 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 CTSZQ9UBR2 303 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TCL1BO95988 128 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TCRAP04437 139 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 LINC00694P0DN24 101 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 LEPP41159 167 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 CALYQ9NYX4 217 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TMEM262E9PQX1 116 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 HLA-DRB4P13762 266 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 ZNF134P52741 427 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 Q86TA4 180 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 FMC1Q96HJ9 113 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 DPM2O94777 84 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 GAS8-AS1O95177 125 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 RASL10AQ92737 203 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 Q9H3A6 140 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 NDUFA3O95167 84 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 CKS2P33552 79 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 A4D1N5 150 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 ZNF785A8K8V0 405 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 RITA1Q96K30 269 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPN3-201ENST00000318023 ZMAT4Q9H898 229 aa7.28□□□□□ -1.24
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