RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 LINC00527Q9UJ94 153 aa21.3■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 H3BUA1 57 aa21.29■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 TRAV21A0A0B4J279 112 aa21.28■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 K7EP34 96 aa21.28■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 IGHV4-39P01824 125 aa21.28■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa21.28■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 GPHB5Q86YW7 130 aa21.28■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa21.28■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 USMG5Q96IX5 58 aa21.28■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 SOCS3O14543 225 aa21.28■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 RNF151Q2KHN1 245 aa21.27■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa21.27■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 SMIM2Q9BVW6 85 aa21.27■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa21.27■□□□□ 0.99
UBP1-201ENST00000283628 A0A087WX48 190 aa21.27■□□□□ 0.99
UBP1-201ENST00000283628 CHAC1Q9BUX1 264 aa21.27■□□□□ 0.99
UBP1-201ENST00000283628 CFAP46Q8IYW2 2715 aa21.26■□□□□ 0.99
UBP1-201ENST00000283628 GTSCR1Q86UQ5 136 aa21.26■□□□□ 0.99
UBP1-201ENST00000283628 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
UBP1-201ENST00000283628 IGSF10Q6WRI0 2623 aa21.26■□□□□ 0.99
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UBP1-201ENST00000283628 K7ERU9 68 aa21.25■□□□□ 0.99
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UBP1-201ENST00000283628 TMEM160Q9NX00 188 aa21.25■□□□□ 0.99
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UBP1-201ENST00000283628 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa21.24■□□□□ 0.99
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UBP1-201ENST00000283628 ASIPP42127 132 aa21.24■□□□□ 0.99
UBP1-201ENST00000283628 ORMDL2Q53FV1 153 aa21.24■□□□□ 0.99
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UBP1-201ENST00000283628 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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UBP1-201ENST00000283628 RAB37Q96AX2 223 aa21.23■□□□□ 0.99
UBP1-201ENST00000283628 PIMREGQ9BSJ6 248 aa21.23■□□□□ 0.99
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UBP1-201ENST00000283628 FAM19A4Q96LR4 140 aa21.22■□□□□ 0.99
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UBP1-201ENST00000283628 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa21.11■□□□□ 0.97
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