RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266254.11

TTLL1-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-201ENST00000266254 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 NEU1Q99519 415 aa16.7■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 NAT8BQ9UHF3 227 aa16.7■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 PYGO2Q9BRQ0 406 aa16.7■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 CXCL1P09341 107 aa16.69■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 GFI1BQ5VTD9 330 aa16.69■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 GZMBP10144 247 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 Q6ZQT7 251 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 WFDC10AQ9H1F0 79 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 C11orf21Q9P2W6 132 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 HIGD1CA8MV81 97 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 AMBPP02760 352 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 FXYD7P58549 80 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 FAM210BQ96KR6 192 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 GTSF1Q8WW33 167 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 NUP35Q8NFH5 326 aa16.66■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 NAGKQ9UJ70 344 aa16.66■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 RAB5AP20339 215 aa16.65■□□□□ 0.26
TTLL1-201ENST00000266254 CRXO43186 299 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 DEFB125Q8N687 156 aa16.64■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 TYMSP04818 313 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 FAM159AQ6UWV7 190 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 GRIFINA4D1Z8 144 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 MUC21Q5SSG8 566 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF575Q86XF7 245 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 KCNS1Q96KK3 526 aa16.63■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 INSP01308 110 aa16.62■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 C20orf144Q9BQM9 153 aa16.62■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 SPINK4O60575 86 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 IGLC6P0CF74 106 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 TPPP3Q9BW30 176 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 TDRG1Q3Y452 100 aa16.6■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa16.6■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 BORCS7Q96B45 105 aa16.6■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 RPS10P46783 165 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 Q8N1Y9 231 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 SRD5A3Q9H8P0 318 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 CTRLP40313 264 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 ASIPP42127 132 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 COX19Q49B96 90 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 XCL2Q9UBD3 114 aa16.59■□□□□ 0.25
TTLL1-201ENST00000266254 A0A1B0GUT8 65 aa16.58■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 F2Z2F3 143 aa16.58■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 RBMY1CP0DJD4 496 aa16.58■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 DNLZQ5SXM8 178 aa16.58■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 RASL11AQ6T310 242 aa16.58■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa16.58■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 DNAH9Q9NYC9 4486 aa16.57■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 B9D2Q9BPU9 175 aa16.57■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 RIGQ13278 110 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 GNRH2O43555 120 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 OR5AL1P0C617 328 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 ARMS2P0C7Q2 107 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 MED14OSP0DP75 135 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 WDR73Q6P4I2 378 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 TMEM256Q8N2U0 113 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 A0A1B0GW15 77 aa16.55■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 A0A1B0GXF2 115 aa16.55■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 HBBP68871 147 aa16.55■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 H3BVH4 76 aa16.54■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 SNAI2O43623 268 aa16.54■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 LINC01587Q99440 93 aa16.54■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.54■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 TRGV11A0A075B6L2 103 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 S100A8P05109 93 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 TMEM208Q9BTX3 173 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 GNB1LQ9BYB4 327 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 CNFNQ9BYD5 112 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 CSTL1Q9H114 145 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 CBY3A6NI87 242 aa16.52■□□□□ 0.24
TTLL1-201ENST00000266254 SNURFLB1AK76 121 aa16.52■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 MT-ND6P03923 174 aa16.52■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 CAMPP49913 170 aa16.52■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 RAB4BP61018 213 aa16.52■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa16.52■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa16.52■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa16.52■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms