RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF492Q9P255 531 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CCSO14618 274 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 PPT1P50897 306 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCF2Q8IXL9 164 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10G4Q8NGN3 311 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8TAT8 98 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM24AA6NFZ4 105 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM25EA8MYX2 175 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIQKQ629K1 86 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 NHLRC2Q8NBF2 726 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A31Q9H0C2 315 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF138P52744 262 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM183BQ1AE95 376 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM183AQ8IXX5 376 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 MITD1Q8WV92 249 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF7P21781 194 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SPXQ9BT56 116 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00528Q8N1L1 170 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 VWC2Q2TAL6 325 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 GCSAMLQ5JQS6 135 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SPANXN2Q5MJ10 180 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SH2D6Q7Z4S9 175 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4C5Q8NGB2 326 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 RASL10AQ92737 203 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A2Q9BXI2 301 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH8Q96JB1 4490 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 TRGV11A0A075B6L2 103 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV4A0A0B4J268 109 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A11P31949 105 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT8Q8NBV8 401 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf51A6NDU8 294 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPXA8MT69 81 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT1A1P50225 295 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A10P60903 97 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 HBG1P69891 147 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 HBG2P69892 147 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01556Q5JQF7 62 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM159AQ6UWV7 190 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 STX12Q86Y82 276 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 NAGKQ9UJ70 344 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QBP02746 253 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 NBEAP1P0C6P0 100 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF266Q14584 549 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 BAK1Q16611 211 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10J3Q5JRS4 329 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 HMCN2Q8NDA2 5059 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC160A6NGH7 325 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-30P01768 117 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-33P01772 117 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CSN1S1P47710 185 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 MIR17HGQ75NE6 70 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF23A1L1A6 192 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 TIRAPP58753 221 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CHAC2Q8WUX2 184 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51M1Q9H341 326 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10J4P0C629 311 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 BTCP35070 178 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 PHYHIPLQ96FC7 376 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 UBR4Q5T4S7 5183 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM252Q8N6L7 170 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 PAXXQ9BUH6 204 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 NPCDR1Q9BY65 106 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf1Q9H5F2 150 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V1FQ16864 119 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R2P5 195 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6AWC8 147 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 TM2D2Q9BX73 214 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PFN1P07737 140 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP6Q8TBB0 222 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf50Q96LR7 162 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 BOLA1Q9Y3E2 137 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 RBAKDNA6NC62 111 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 RANP62826 216 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 FXYD5Q96DB9 178 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 LECT2O14960 151 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 OR7C2O60412 319 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 WFDC2Q14508 124 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZSA8 131 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 GNRH2O43555 120 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB32Q13637 225 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC22CQ9BRL7 303 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PRADC1Q9BSG0 188 aa18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160.4 ms