RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 LTBP1Q14766 1721 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 NTF4P34130 210 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 C15orf62A8K5M9 175 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF524Q96C55 264 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 LTAP01374 205 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF134P52741 427 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PR77 199 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 TEN1Q86WV5 123 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 SRRM5B3KS81 715 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV3-19P01714 112 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-209ENST00000612229 MST1LQ2TV78 715 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 MUC4Q99102 2169 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 H0YJW9 148 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 MDS2Q8NDY4 140 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L23D6RBM5 183 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 C20orf173Q96LM9 149 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 PSPNO60542 156 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 C5orf63A6NC05 138 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 TIAF1O95411 115 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 J3QLI3 93 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 C17orf77Q96MU5 243 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 PATE3B3GLJ2 98 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 EFNA4P52798 201 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WV48 116 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 J3QQQ9 107 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 TFF2Q03403 129 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 A4D1N5 150 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 CRYGCP07315 174 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 Q6P435 159 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV1D-12P01611 117 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 TM2D2Q9BX73 214 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV3-11P01762 117 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 PRDM6Q9NQX0 595 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 SMKR1H3BMG3 65 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 PFN2P35080 140 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 C14orf177Q52M58 125 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRT-209ENST00000612229 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 FAM201AQ5SY85 155 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 TIRAPP58753 221 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 FOXF2Q12947 444 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 V9GYV3 84 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 H3BUA1 57 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 VPREB1P12018 145 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 MORN5Q5VZ52 161 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01560Q8TB33 94 aa5.62□□□□□ -1.51
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