RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 HLA-DMBP28068 263 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 LPAL2Q16609 132 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 ORM1P02763 201 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 CITED1Q99966 193 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 A6NJY4 79 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 TEN1Q86WV5 123 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 CCL17Q92583 94 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 AGRNO00468 2067 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 PRAC2D3DTV9 90 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 CTSGP08311 255 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 SPINK8P0C7L1 97 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 BSPH1Q075Z2 132 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
HCG18-242ENST00000602319 TIMM23O14925 209 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 EFNA4P52798 201 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 DLX1P56177 255 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 Q8N6K4 173 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 ODF3BA8MYP8 253 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 CEP290O15078 2479 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 CNIH1O95406 144 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 BAALCQ8WXS3 180 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 ZZEF1O43149 2961 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 M0R381 172 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 RASL10AQ92737 203 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 Q5PR19 223 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 LINC01549A6NIU2 74 aa7.56□□□□□ -1.2
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HCG18-242ENST00000602319 GLMPQ8WWB7 406 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 BUB3O43684 328 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 SRD5A1P18405 259 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 PIP4P1Q86T03 277 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 RAXQ9Y2V3 346 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 ZNF688P0C7X2 276 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 EBI3Q14213 229 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 RNF183Q96D59 192 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 S4R3C0 116 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 TCL1BO95988 128 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 CRYGDP07320 174 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 MED14OSP0DP75 135 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 A0A0G2JNJ9 132 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 A0A0J9YY99 117 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 SCGB2A1O75556 95 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 Q9UFV3 132 aa7.55□□□□□ -1.2
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HCG18-242ENST00000602319 E7EQL1 145 aa7.54□□□□□ -1.2
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HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 AMELXQ99217 191 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 U3KQE9 123 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 CADP27708 2225 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 LINC01548A6NM66 108 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 COX7A1P24310 79 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 PSMB2P49721 201 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 DPM3Q9P2X0 92 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 FAM186AA6NE01 2351 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 ZNF815PA8K554 130 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HCG18-242ENST00000602319 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.53□□□□□ -1.2
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