RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-222	ENST00000597718	BUB3	O43684	328 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718		Q6ZTC4	211 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	FMC1	Q96HJ9	113 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	ATG101	Q9BSB4	218 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	PGP	A6NDG6	321 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	COLCA2	A8K830	154 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	DEFB1	P60022	68 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	BLNK	Q8WV28	456 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	ISOC2	Q96AB3	205 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	XCL2	Q9UBD3	114 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	CELA1	Q9UNI1	258 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	GALR1	P47211	349 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	UBE2G1	P62253	170 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	SFRP2	Q96HF1	295 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718		Q9H3A6	140 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718		A0A087X0K7	114 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718		H3BMM0	161 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	CSN1S1	P47710	185 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	TCTA	P57738	103 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	RAB5A	P20339	215 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	FXYD7	P58549	80 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	CENPW	Q5EE01	88 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	OCC1	Q8TAD7	63 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	DERL1	Q9BUN8	251 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-222	ENST00000597718	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	ISLR	O14498	428 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	GCG	P01275	180 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	TCRA	P04437	139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	RAB5B	P61020	215 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	ELOB	Q15370	118 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	YPEL4	Q96NS1	127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	OSTC	Q9NRP0	149 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	HERC2	O95714	4834 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	BAGE2	Q86Y30	109 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	SOCS3	O14543	225 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	EMP1	P54849	157 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	ERVFC1-1	P60608	527 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718		F6UB75	175 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	LTA	P01374	205 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	ID1	P41134	155 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	COX19	Q49B96	90 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	AMBP	P02760	352 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	IL36B	Q9NZH7	164 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	TYMS	P04818	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-222	ENST00000597718	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79

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