RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NMBP08949 121 aa17.39■□□□□ 0.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 GCSAMLQ5JQS6 135 aa17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 NEGR1Q7Z3B1 354 aa17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 FRZBQ92765 325 aa17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf51A6NDU8 294 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNA5P01569 189 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF7P21781 194 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT1A1P50225 295 aa17.38■□□□□ 0.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 ARPC5LQ9BPX5 153 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A2Q9BXI2 301 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 AAMDCQ9H7C9 122 aa17.38■□□□□ 0.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 S100A11P31949 105 aa17.37■□□□□ 0.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 Q8TAT8 98 aa17.35■□□□□ 0.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SFTA3P0C7M3 94 aa17.34■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa17.34■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 STX12Q86Y82 276 aa17.34■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa17.34■□□□□ 0.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa17.33■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SIX6O95475 246 aa17.33■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SRIP30626 198 aa17.33■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HBG1P69891 147 aa17.33■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HBG2P69892 147 aa17.33■□□□□ 0.36
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T35Q8NGX2 323 aa17.33■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF479Q96JC4 524 aa17.33■□□□□ 0.36
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CAPNS1-211ENST00000590874 GYPEP15421 78 aa17.3■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 EVI2AP22794 236 aa17.3■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1FQ16864 119 aa17.3■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCF2Q8IXL9 164 aa17.3■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP6Q8TBB0 222 aa17.3■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 K7EP13 123 aa17.29■□□□□ 0.36
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CAPNS1-211ENST00000590874 PHYHIPLQ96FC7 376 aa17.29■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51M1Q9H341 326 aa17.29■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa17.28■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10J4P0C629 311 aa17.28■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 G3V3Q6 166 aa17.27■□□□□ 0.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF266Q14584 549 aa17.27■□□□□ 0.36
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CAPNS1-211ENST00000590874 PET100P0DJ07 73 aa17.25■□□□□ 0.35
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM183AQ8IXX5 376 aa17.25■□□□□ 0.35
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CAPNS1-211ENST00000590874 MPC2O95563 127 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6AWC8 147 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf126Q8N4M7 172 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5C1Q8NGR4 320 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNDC17Q9BRA2 123 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SPXQ9BT56 116 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A31Q9H0C2 315 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 LRCOL1A6NCL2 159 aa17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 HMSDA8MTL9 139 aa17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-211ENST00000590874 C9JCJ5 164 aa17.22■□□□□ 0.35
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