RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 RAB24Q969Q5 203 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 GAGE12BA1L429 117 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 GAGE7O76087 117 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 IFNA7P01567 189 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 GAGE12FP0CL80 117 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 GAGE12GP0CL81 117 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 GAGE12IP0CL82 117 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 STAG3L2P0CL84 134 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 STAG3L3P0CL85 134 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 TAS2R45P59539 299 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 IFITM2Q01629 132 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 Q9H8V8 135 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 CT45A10P0DMU9 189 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP10-2P60368 255 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 ESRGQ1W209 222 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZTI0 123 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 ZNF503Q96F45 646 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 Q9H3A6 140 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 PYYP10082 97 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 KHDC3LQ587J8 217 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 UPK3BQ9BT76 320 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 PAXXQ9BUH6 204 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 OR51M1Q9H341 326 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 OR7C2O60412 319 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 ZNF253O75346 499 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 CXorf1O96002 111 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 BLOC1S1P78537 153 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 TTC32Q5I0X7 151 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 FXYD5Q96DB9 178 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 ODF3Q96PU9 254 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 SNURFLB1AK76 121 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 M0R3E3 92 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 NDUFB4O95168 129 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 OR10J4P0C629 311 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 GCHFRP30047 84 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 LEPP41159 167 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 ERCC8Q13216 396 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 Q8N1X5 172 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 SUN5Q8TC36 379 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-208ENST00000590422 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 A0A096LPF7 62 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GV50 99 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 H3BNG1 76 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 GUK1Q16774 197 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 C7orf71A4D174 169 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 KLLNB2CW77 178 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 TEX46H3BTG2 121 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 NMBP08949 121 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 LINC00315P59091 139 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 CCL20P78556 96 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 BTN1A1Q13410 526 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 PDE6HQ13956 83 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 BLNKQ8WV28 456 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PPQ1 181 aa8.31□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 RGS13O14921 159 aa8.31□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 PRR9Q5T870 116 aa8.31□□□□□ -1.08
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZQT7 251 aa8.31□□□□□ -1.08
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