RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 LINC01549A6NIU2 74 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV1-69P01742 117 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 APOHP02749 345 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 IGLC3P0DOY3 106 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 G0S2P27469 103 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 SAA4P35542 130 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 RHOGP84095 191 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE1Q13065 139 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 C15orf32Q32M92 178 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 CLEC2AQ6UVW9 174 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-215ENST00000583289 ORMDL3Q8N138 153 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 LINC00477Q96M19 166 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRM-215ENST00000583289 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM89A2RUT3 159 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 GAGE10A6NGK3 116 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 C2orf70A6NJV1 201 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 B4DSR2 109 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 K7EMI3 77 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 OVOL1O14753 267 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R17O96001 155 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 IGF1P05019 195 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 CDKN1AP38936 164 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 CTRLP40313 264 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF138P52744 262 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 Q6ZN92 141 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 K7EMT4 169 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 TEX29Q8N6K0 151 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 Q8N976 141 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRM-215ENST00000583289 PRELID3AQ96N28 172 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-215ENST00000583289 CCL19Q99731 98 aa3.45□□□□□ -1.86
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