RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 Q6AWC8 147 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZWC4 215 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 MRAPQ8TCY5 172 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 XCL2Q9UBD3 114 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-211ENST00000582232 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 IGLV2-8P01709 118 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 FXYD7P58549 80 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 KIR3DS1Q14943 382 aa8.39□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 C8orf49Q96NF6 230 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 ASCL2Q99929 193 aa8.39□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.39□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 SFTA3P0C7M3 94 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 CEBPGP53567 150 aa8.38□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.38□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.38□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 TMEM218A2RU14 115 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 GCGP01275 180 aa8.37□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 BTN1A1Q13410 526 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 OCC1Q8TAD7 63 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 RNF183Q96D59 192 aa8.37□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 H7BYZ3 331 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 RCHY1Q96PM5 261 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGA3-211ENST00000582232 K7EN84 100 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 SPRY2O43597 315 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 DEFB135Q30KP9 77 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 TDRG1Q3Y452 100 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 LINC01551Q86U37 167 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 SEC11CQ9BY50 192 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 SH2D1AO60880 128 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZQT7 251 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 SPATA25Q9BR10 227 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 TENM3Q9P273 2699 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-211ENST00000582232 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-211ENST00000582232 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 KCNS1Q96KK3 526 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 LINC01587Q99440 93 aa8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-211ENST00000582232 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-211ENST00000582232 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-211ENST00000582232 OR5I1Q13606 314 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 LINC01559Q495D7 138 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 OR11H2Q8NH07 326 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 ISOC2Q96AB3 205 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-211ENST00000582232 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.32□□□□□ -1.08
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