RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF492Q9P255 531 aa6.8□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 PGPA6NDG6 321 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 NUDT3O95989 172 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 CRISP2P16562 243 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 M6PRP20645 277 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 Q6ZTI0 123 aa6.79□□□□□ -1.32
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TOP3A-211ENST00000581536 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 MUC4Q99102 2169 aa6.79□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 PKHD1P08F94 4074 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 A0A1W2PPV4 95 aa6.78□□□□□ -1.32
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TOP3A-211ENST00000581536 ATP6V0CP27449 155 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 ATP5G3P48201 142 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF138P52744 262 aa6.78□□□□□ -1.32
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TOP3A-211ENST00000581536 OR5I1Q13606 314 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 KHDC3LQ587J8 217 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 LCE4AQ5TA78 99 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 AQP10Q96PS8 301 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3A-211ENST00000581536 A0A0J9YY99 117 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 RNF222A6NCQ9 220 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 SNURFLB1AK76 121 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 G3V3Q6 166 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 CSN1S1P47710 185 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 MUC21Q5SSG8 566 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 SSX7Q7RTT5 188 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 SGK494Q96LW2 274 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.77□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 SMLR1H3BR10 107 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 RTL8CO15255 209 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 NMBP08949 121 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TAS2R45P59539 299 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 GNG5P63218 68 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 RGS21Q2M5E4 152 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 RNF212Q495C1 297 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 RAB24Q969Q5 203 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TVP23CQ96ET8 276 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 OTORQ9NRC9 128 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 RBAKDNA6NC62 111 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 STAG3L2P0CL84 134 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 STAG3L3P0CL85 134 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 Q6ZR54 194 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 MDFICQ9P1T7 246 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 GNRH2O43555 120 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 SPINK4O60575 86 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 GCHFRP30047 84 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF266Q14584 549 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF726P1Q15940 193 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ESRGQ1W209 222 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 SUN5Q8TC36 379 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 ATG101Q9BSB4 218 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3-53P01767 116 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 TCL1AP56279 114 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-211ENST00000581536 SERF2P84101 59 aa6.73□□□□□ -1.33
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