RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 TAL2Q16559 108 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 LCE1DQ5T752 114 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 Q8WTZ3 238 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 APH1BQ8WW43 257 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 SOSTQ9BQB4 213 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 PRO0255Q9UI72 69 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 IL4P05112 153 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 CHTF8P0CG12 524 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 PSMB9P28065 219 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 HSPA13P48723 471 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 MEOX2P50222 304 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 CRYBA4P53673 196 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 ARPC4P59998 168 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 C5orf47Q569G3 176 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 Q8N976 141 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 C7orf33Q8WU49 177 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 LECT2O14960 151 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 KRASP01116 189 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 IGLC1P0CG04 106 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 GADD45AP24522 165 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 SRIP30626 198 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 TALDO1P37837 337 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 RANBP1P43487 201 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 Q1RN00 199 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 HES5Q5TA89 166 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 Q6ZTI0 123 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 VGLL1Q99990 258 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 SLC25A22Q9H936 323 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 VAX2Q9UIW0 290 aa3.22□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM235A6NFC5 223 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 SMLR1H3BR10 107 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
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TRIM25-208ENST00000574234 GCGP01275 180 aa3.21□□□□□ -1.9
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TRIM25-208ENST00000574234 F2RP25116 425 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 SNCAP37840 140 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 OPRK1P41145 380 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 CLDN12P56749 244 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 UBE2G2P60604 165 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 REG3AQ06141 175 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 SPCS2Q15005 226 aa3.21□□□□□ -1.9
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TRIM25-208ENST00000574234 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.21□□□□□ -1.9
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 BORCS5Q969J3 196 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.21□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 H7C1H1 209 aa3.2□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 PPYP01298 95 aa3.2□□□□□ -1.9
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TRIM25-208ENST00000574234 G6PCP35575 357 aa3.2□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
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TRIM25-208ENST00000574234 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.2□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.2□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 OR51H1Q8NH63 302 aa3.2□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.2□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 RNF185Q96GF1 192 aa3.2□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.2□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
TRIM25-208ENST00000574234 Q9H521 79 aa3.2□□□□□ -1.9
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