RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 C11orf44Q8N8P7 122 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAX2Q96IS3 184 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 OTOGQ6ZRI0 2925 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 HBBP68871 147 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 FHL3Q13643 280 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa21.89■■□□□ 1.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 TFPI2P48307 235 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTORP42345 2549 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PROK1P58294 105 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PRX2 142 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCL24O00175 119 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSN3P07498 182 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC01559Q495D7 138 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 ORM1P02763 201 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1B0GUT8 65 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CAMPP49913 170 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 BORCS7Q96B45 105 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM19A4Q96LR4 140 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAV2A0A0B4J234 112 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 F6UB75 175 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 APCSP02743 223 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 RIGQ13278 110 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1B0GW15 77 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRLF1O75462 422 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF688P0C7X2 276 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 DEFB1P60022 68 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSMG4Q5JS54 123 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 S100A8P05109 93 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKR1D1P51857 326 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 GDF5OSQ5U4N7 250 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 DYNLRB2Q8TF09 96 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa21.83■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRISP2P16562 243 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 APRG1Q8IVJ8 170 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARMS2P0C7Q2 107 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST3H2BBQ8N257 126 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 CUBNO60494 3623 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGLC6P0CF74 106 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLAQ13239 276 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 LYZL1Q6UWQ5 148 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPPP3Q9BW30 176 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPX1P07203 203 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 DEFB114Q30KQ6 69 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 EBLN2Q6P2I7 272 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ODF3Q96PU9 254 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAV21A0A0B4J279 112 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A0J9YX75 114 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTRLP40313 264 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR9Q5T870 116 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 GFI1BQ5VTD9 330 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA1644Q3SXP7 199 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF575Q86XF7 245 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 GATD1Q8NB37 220 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1B0GUS0 222 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q0VG73 95 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM61Q8N0U2 210 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 C11orf21Q9P2W6 132 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 S100A2P29034 98 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXI2Q6ZQN5 318 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAV25A0A0B4J276 109 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRIFINA4D1Z8 144 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 F2Z2F3 143 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR10J3Q5JRS4 329 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 J3KRW8 73 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 SRIP30626 198 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 LEPP41159 167 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFITM10A6NMD0 228 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLLNB2CW77 178 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD33P20138 364 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDZD11Q5EBL8 140 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFA11Q86Y39 141 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF493Q6ZR52 646 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNFNQ9BYD5 112 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 NF1P21359 2839 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4C46A6NHA9 309 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa21.7■■□□□ 1.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 BAGE3Q86Y29 109 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSPOP30536 169 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q6ZQT7 251 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 DEFB131AP59861 70 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRTAP10-3P60369 221 aa21.67■■□□□ 1.06
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