RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572656.2

TRAPPC1-205, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-205ENST00000572656 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 C5orf51A6NDU8 294 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CRYGDP07320 174 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 GYPEP15421 78 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 FGF7P21781 194 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 HBG1P69891 147 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 HBG2P69892 147 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ATP6V1FQ16864 119 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 Q6ZSN1 163 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 STX12Q86Y82 276 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF479Q96JC4 524 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 C2orf50Q96LR7 162 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGSF23A1L1A6 192 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 SFTA3P0C7M3 94 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF266Q14584 549 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 Q8TAT8 98 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 RASL10AQ92737 203 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 SPXQ9BT56 116 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 C9JCJ5 164 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 PSCAO43653 123 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 IL7P13232 177 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 S100A10P60903 97 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 HAMPP81172 84 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 IL15RAQ13261 267 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 MUC21Q5SSG8 566 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR51M1Q9H341 326 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 RBAKDNA6NC62 111 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 J3QL48 77 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLA2G10O15496 165 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 CSN1S1P47710 185 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TIRAPP58753 221 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 RAB32Q13637 225 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 Q6AWC8 147 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 FXYD5Q96DB9 178 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 PAXXQ9BUH6 204 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 LYRM1O43325 122 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TCRBP04435 133 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR10J4P0C629 311 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 Q8N814 137 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 THAP6Q8TBB0 222 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 M0R2P5 195 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 C1QBP02746 253 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 RANP62826 216 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 NHLH2Q02577 135 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TDRG1Q3Y452 100 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 NUDT15Q9NV35 164 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 DIRC3C9JPN6 131 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR7C2O60412 319 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 PPT1P50897 306 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMED6Q8WW62 240 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 NAGKQ9UJ70 344 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC1-205ENST00000572656 GNRH2O43555 120 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC1-205ENST00000572656 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC1-205ENST00000572656 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC1-205ENST00000572656 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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