RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 RNF185Q96GF1 192 aa16.23■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 C20orf173Q96LM9 149 aa16.23■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa16.23■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 H3BUX3 64 aa16.23■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 C19orf54Q5BKX5 351 aa16.23■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 PIMREGQ9BSJ6 248 aa16.23■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 ATP5J2P56134 94 aa16.22■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 LINC01545Q5VT33 79 aa16.22■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 ERASQ7Z444 233 aa16.22■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.22■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 ARL3P36405 182 aa16.22■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF124Q15973 351 aa16.22■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 AVPP01185 164 aa16.21■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 MPV17L2Q567V2 206 aa16.21■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 PRR9Q5T870 116 aa16.21■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa16.21■□□□□ 0.19
TMEM260-216ENST00000557657 SLC50A1Q9BRV3 221 aa16.21■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 ST20Q9HBF5 79 aa16.21■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 U3KQE9 123 aa16.2■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 C16orf92Q96LL3 132 aa16.2■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa16.2■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 RAB9AP51151 201 aa16.19■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM78Q5T7P6 136 aa16.19■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.19■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.19■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 LRRK2Q5S007 2527 aa16.19■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 EDN2P20800 178 aa16.19■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 LINC01559Q495D7 138 aa16.19■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 HSBP1L1C9JCN9 74 aa16.18■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 GPHB5Q86YW7 130 aa16.18■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 C18orf15Q96N68 181 aa16.18■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM95Q3KNT9 176 aa16.18■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa16.17■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 S100A7P31151 101 aa16.17■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 CACNG7P62955 275 aa16.17■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 SLC25A34Q6PIV7 304 aa16.17■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 CLEC2AQ6UVW9 174 aa16.17■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 GLMPQ8WWB7 406 aa16.17■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 RBAKDNA6NC62 111 aa16.16■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 NUDT3O95989 172 aa16.16■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 PF4V1P10720 104 aa16.16■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF462Q96JM2 2506 aa16.16■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 F6UB75 175 aa16.16■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 ANKRD39Q53RE8 183 aa16.16■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.16■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 SRD5A1P18405 259 aa16.15■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 RPL11P62913 178 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 KIR3DS1Q14943 382 aa16.15■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF738Q8NE65 137 aa16.15■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 CNFNQ9BYD5 112 aa16.15■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 MXRA5Q9NR99 2828 aa16.15■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa16.15■□□□□ 0.18
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa16.14■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 FAM223BA6NKX1 122 aa16.14■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 FAM223AQ8IWN6 122 aa16.14■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 HIF1ANQ9NWT6 349 aa16.14■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 TCF21O43680 179 aa16.14■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 HBDP02042 147 aa16.14■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 DMRTA1Q5VZB9 504 aa16.14■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 TNFRSF6BO95407 300 aa16.13■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 UFC1Q9Y3C8 167 aa16.13■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 A6NDX4 124 aa16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 MSMBP08118 114 aa16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 TM4SF20Q53R12 229 aa16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 ABCA12Q86UK0 2595 aa16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 H3BVH4 76 aa16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 GAGE1Q13065 139 aa16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 OR4X2Q8NGF9 303 aa16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 DKK2Q9UBU2 259 aa16.12■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 IGHG2P01859 326 aa16.11■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.11■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 USP24Q9UPU5 2620 aa16.11■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 LEPP41159 167 aa16.11■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 IFI27L1Q96BM0 104 aa16.11■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 PTPN13Q12923 2485 aa16.1■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 PRB1P04280 392 aa16.1■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 SPOCK3Q9BQ16 436 aa16.1■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 MAP1LC3AQ9H492 121 aa16.1■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa16.1■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 C2orf91Q6ZV80 131 aa16.09■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.09■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 COX11Q9Y6N1 276 aa16.09■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 CCL25O15444 150 aa16.08■□□□□ 0.17
TMEM260-216ENST00000557657 MS4A6AQ9H2W1 248 aa16.08■□□□□ 0.16
TMEM260-216ENST00000557657 CUBNO60494 3623 aa16.07■□□□□ 0.16
TMEM260-216ENST00000557657 NDUFA4O00483 81 aa16.07■□□□□ 0.16
TMEM260-216ENST00000557657 SOCS3O14543 225 aa16.07■□□□□ 0.16
TMEM260-216ENST00000557657 COX8AP10176 69 aa16.07■□□□□ 0.16
TMEM260-216ENST00000557657 SPANXN1Q5VSR9 72 aa16.07■□□□□ 0.16
TMEM260-216ENST00000557657 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa16.07■□□□□ 0.16
TMEM260-216ENST00000557657 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TMEM260-216ENST00000557657 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms