RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557397.5

TIMM9-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 4

Gene TIMM9, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-210	ENST00000557397	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM238	C9JI98	176 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397		F8W036	122 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	CIAO1	O76071	339 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF682	O95780	498 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	C1QC	P02747	245 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SERPINE1	P05121	402 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	MSMB	P08118	114 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	RBP1	P09455	135 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	UBB	P0CG47	229 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	GPX2	P18283	190 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ELOB	Q15370	118 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	NNAT	Q16517	81 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	OOSP2	Q86WS3	158 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	MCFD2	Q8NI22	146 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	GINS4	Q9BRT9	223 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	MED29	Q9NX70	200 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IL20	Q9NYY1	176 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	MYH3	P11055	1940 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	MYH8	P13535	1937 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	TNFSF15	O95150	251 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	C8G	P07360	202 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	CRYGA	P11844	174 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SRI	P30626	198 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	CDC42	P60953	191 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	RHOB	P62745	196 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397		Q96M85	177 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	CHST6	Q9GZX3	395 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.94	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IRGM	A1A4Y4	181 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	OR2J2	O76002	312 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ATG12	O94817	140 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IFNA10	P01566	189 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	C1QA	P02745	245 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SHBG	P04278	402 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ATP5G3	P48201	142 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	TAS2R41	P59536	307 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	VBP1	P61758	197 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	CDK5R1	Q15078	307 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	RHEB	Q15382	184 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	LINC00471	Q8N535	108 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	TERB2	Q8NHR7	220 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	NEK7	Q8TDX7	302 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	PLXNA2	O75051	1894 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397		E5RI56	91 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	CST8	O60676	142 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	BANF1	O75531	89 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	OR2B3	O76000	313 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TIMM9-210	ENST00000557397	FABP1	P07148	127 aa		0.92	□□□□□ -2.26

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