RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555569.1

PCNX4-209, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-209ENST00000555569 SPINK4O60575 86 aa9.59□□□□□ -0.87
PCNX4-209ENST00000555569 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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PCNX4-209ENST00000555569 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.59□□□□□ -0.87
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PCNX4-209ENST00000555569 DIRC3C9JPN6 131 aa9.58□□□□□ -0.88
PCNX4-209ENST00000555569 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
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PCNX4-209ENST00000555569 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.56□□□□□ -0.88
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PCNX4-209ENST00000555569 TTC32Q5I0X7 151 aa9.55□□□□□ -0.88
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PCNX4-209ENST00000555569 MED28Q9H204 178 aa9.55□□□□□ -0.88
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PCNX4-209ENST00000555569 ZNF575Q86XF7 245 aa9.54□□□□□ -0.88
PCNX4-209ENST00000555569 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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PCNX4-209ENST00000555569 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.53□□□□□ -0.88
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PCNX4-209ENST00000555569 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.52□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 SPXQ9BT56 116 aa9.52□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 A0A1W2PPQ1 181 aa9.51□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 STAG3L2P0CL84 134 aa9.51□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 STAG3L3P0CL85 134 aa9.51□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 ATP6V0CP27449 155 aa9.51□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 CRYBA4P53673 196 aa9.51□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 GNG5P63218 68 aa9.51□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 FHL2Q14192 279 aa9.51□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 C8orf49Q96NF6 230 aa9.51□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 NAGKQ9UJ70 344 aa9.51□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.5□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.5□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.5□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 F6UZH7 168 aa9.5□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 MBP02144 154 aa9.5□□□□□ -0.89
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PCNX4-209ENST00000555569 Q5BKY6 102 aa9.5□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 ASB13Q8WXK3 278 aa9.5□□□□□ -0.89
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PCNX4-209ENST00000555569 RAB24Q969Q5 203 aa9.5□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 TVP23CQ96ET8 276 aa9.5□□□□□ -0.89
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PCNX4-209ENST00000555569 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.49□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 C16orf90A8MZG2 172 aa9.49□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 SFTA3P0C7M3 94 aa9.49□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 GCHFRP30047 84 aa9.49□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 SERF2P84101 59 aa9.49□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 SUN5Q8TC36 379 aa9.49□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.48□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 SIVA1O15304 175 aa9.48□□□□□ -0.89
PCNX4-209ENST00000555569 GNRH2O43555 120 aa9.48□□□□□ -0.89
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