RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 ZFP69Q49AA0 526 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 Q6ZQT7 251 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 Q6ZTI0 123 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 C16orf74Q96GX8 76 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SMIM8Q96KF7 97 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 C20orf85Q9H1P6 137 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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GNPTAB-209ENST00000552009 COX7A2P2O60397 106 aa4.72□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CST7O76096 145 aa4.72□□□□□ -1.65
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GNPTAB-209ENST00000552009 CT45A10P0DMU9 189 aa4.72□□□□□ -1.65
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GNPTAB-209ENST00000552009 KRTAP10-12P60413 245 aa4.72□□□□□ -1.65
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GNPTAB-209ENST00000552009 MIC13Q5XKP0 118 aa4.72□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 MED28Q9H204 178 aa4.72□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 Q9H8V8 135 aa4.72□□□□□ -1.65
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GNPTAB-209ENST00000552009 FAM24AA6NFZ4 105 aa4.71□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM25EA8MYX2 175 aa4.71□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 H7BYZ3 331 aa4.71□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 CDK2AP2O75956 126 aa4.71□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 IGHV3-53P01767 116 aa4.71□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.71□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 SEC22CQ9BRL7 303 aa4.71□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 NPVFQ9HCQ7 196 aa4.71□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.71□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa4.7□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.7□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 PRR9Q5T870 116 aa4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 NFE4Q86UQ8 179 aa4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.7□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.7□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.7□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 L7N2F9 121 aa4.69□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 S100A7P31151 101 aa4.69□□□□□ -1.66
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GNPTAB-209ENST00000552009 LINC00315P59091 139 aa4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 S100A10P60903 97 aa4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 VAMP2P63027 116 aa4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 HAMPP81172 84 aa4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 BLNKQ8WV28 456 aa4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4.69□□□□□ -1.66
GNPTAB-209ENST00000552009 HYLS1Q96M11 299 aa4.69□□□□□ -1.66
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