RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 TVP23CQ96ET8 276 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 LINC00479Q96M42 142 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 MLST8Q9BVC4 326 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 AGRNO00468 2067 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 C7orf71A4D174 169 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 Q6AWC8 147 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 KCNS1Q96KK3 526 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 DERL1Q9BUN8 251 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 XKRY2A2RUG3 117 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 PPP1R2P9O14990 202 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 GCGP01275 180 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 Q6ZWC4 215 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 LINC01551Q86U37 167 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SVBPQ8N300 66 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 OCC1Q8TAD7 63 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 Q8TAT8 98 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SGK494Q96LW2 274 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 ANK2Q01484 3957 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 NOTCH1P46531 2555 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 H7BYZ3 331 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SNAPINO95295 136 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 IGKV3-20P01619 116 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 MT-ND4LP03901 98 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 S100A1P23297 94 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 DEFB1P60022 68 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 ZNF124Q15973 351 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 M0R2Z0 102 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 IGLV2-8P01709 118 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 P01737 135 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 ERVFC1-1P60608 527 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 ADIRFQ15847 76 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 TDRG1Q3Y452 100 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 CT83Q5H943 113 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 OSTCQ9NRP0 149 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 FAM231BA6NCW3 169 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 M0R036 132 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 CXCL1P09341 107 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 RHEBQ15382 184 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 ISOC2Q96AB3 205 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 SFRP2Q96HF1 295 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 C8orf49Q96NF6 230 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 LINC01587Q99440 93 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 NEU1Q99519 415 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 XCL2Q9UBD3 114 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 TMEM189A5PLL7 270 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 A8MWL6 223 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 SH2D1AO60880 128 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-220ENST00000550700 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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