RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 Q0VG73 95 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-226ENST00000546160 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-226ENST00000546160 C20orf78Q9BR46 151 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-226ENST00000546160 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-226ENST00000546160 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-226ENST00000546160 VOPP1Q96AW1 172 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-226ENST00000546160 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-226ENST00000546160 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-226ENST00000546160 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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PDE4D-226ENST00000546160 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.09□□□□□ -1.59
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PDE4D-226ENST00000546160 C16orf74Q96GX8 76 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM89A2RUT3 159 aa5.09□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.09□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 WDR86Q86TI4 376 aa5.09□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 Q8NFD4 153 aa5.09□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 C8orf49Q96NF6 230 aa5.09□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 PRR25Q96S07 402 aa5.09□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 LINC01545Q5VT33 79 aa5.09□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C22orf46C9J442 243 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 CGB3P0DN86 165 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0G2JRQ6 117 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0U1RRA0 63 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 G3V318 75 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 IL17DQ8TAD2 202 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.08□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZRM9 215 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 DSCR8Q96T75 97 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 AGRNO00468 2067 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 RIPPLY3P57055 190 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 NPC2P61916 151 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM126AQ9H061 195 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 COLCA2A8K830 154 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 A8MWP6 167 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 GAGE12BA1L429 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 CRLF1O75462 422 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 GAGE7O76087 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 GAGE12FP0CL80 117 aa5.07□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 GAGE12IP0CL82 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 HLA-DRB4P13762 266 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.07□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 IGLC1P0CG04 106 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 HERV-K104P63124 156 aa5.07□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.06□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.06□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 MLANAQ16655 118 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 SORL1Q92673 2214 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 GAGE2BQ13066 116 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 CCL18P55774 89 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.06□□□□□ -1.6
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PDE4D-226ENST00000546160 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 MMP23AO75900 390 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 RNF144BQ7Z419 303 aa5.05□□□□□ -1.6
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