RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF503Q96F45 646 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 HYLS1Q96M11 299 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 SPXQ9BT56 116 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 H3BNG1 76 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 STAG3L3P0CL85 134 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.99□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.98□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 TTC32Q5I0X7 151 aa3.98□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.98□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.98□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 C18orf15Q96N68 181 aa3.98□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 GAGE7O76087 117 aa3.97□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 ORM1P02763 201 aa3.97□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 GAGE12IP0CL82 117 aa3.97□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 MED14OSP0DP75 135 aa3.97□□□□□ -1.77
CLSTN3-215ENST00000544584 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.97□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.97□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.97□□□□□ -1.77
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CLSTN3-215ENST00000544584 PAX4O43316 350 aa3.96□□□□□ -1.78
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CLSTN3-215ENST00000544584 SEC11BP0C7V7 166 aa3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 S100A4P26447 101 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 FHITP49789 147 aa3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 CD300CQ08708 224 aa3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 BTN1A1Q13410 526 aa3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 TDRG1Q3Y452 100 aa3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
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