RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	CRISP2	P16562	243 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	TCL1A	P56279	114 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00315	P59091	139 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	ICAM4	Q14773	271 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	SIVA1	O15304	175 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	PAX4	O43316	350 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	RGS13	O14921	159 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-53	P01767	116 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	NMB	P08949	121 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	VGLL1	Q99990	258 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		11	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	PRR9	Q5T870	116 aa		11	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZQT7	251 aa		11	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF492	Q9P255	531 aa		11	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	NXPH4	O95158	308 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	PRO0255	Q9UI72	69 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	SLA	Q13239	276 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	AKAP14	Q86UN6	197 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	HMSD	A8MTL9	139 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	IFNA5	P01569	189 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF138	P52744	262 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	CRYBA4	P53673	196 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	FHL2	Q14192	279 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	C8orf49	Q96NF6	230 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	EREG	O14944	169 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	OR10J4	P0C629	311 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF415	Q09FC8	603 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777		Q8TAT8	98 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX11-222	ENST00000542777	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	C1QB	P02746	253 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	ERVFC1-1	P60608	527 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	10.94	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	CSN1S1	P47710	185 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	RAB2A	P61019	212 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF345	Q14585	488 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	MUC21	Q5SSG8	566 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		10.93	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	OR7C2	O60412	319 aa		10.93	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF266	Q14584	549 aa		10.93	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	NFE4	Q86UQ8	179 aa		10.93	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		10.93	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.92	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.92	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	SFTA3	P0C7M3	94 aa		10.92	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	TMUB2	Q71RG4	321 aa		10.92	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		10.92	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF479	Q96JC4	524 aa		10.92	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		10.92	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	EPM2A	B3EWF7	344 aa		10.91	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777		K7EQD1	137 aa		10.91	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	BCL2L11	O43521	198 aa		10.91	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	SRI	P30626	198 aa		10.91	□□□□□ -0.66
DDX11-222	ENST00000542777	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		10.91	□□□□□ -0.66

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